Суперкомпьютер МГУ поможет найти лекарство от коронавируса

Сотрудники лаборатории вычислительных систем и прикладных технологий программирования научно-исследовательского вычислительного центра (НИВЦ) МГУ приступили к масштабным расчетам на суперкомпьютере "Ломоносов", которые помогут найти лекарство прямого действия от коронавируса. Об этом во вторник сообщила пресс-служба университета.

Суперкомпьютерные технологии уже зарекомендовали себя в вопросе поиска и создания новых лекарств, способных бороться с различными заболеваниями. Сверхмощные вычислительные системы помогут значительно ускорить подбор молекул для потенциального лекарства, способного воздействовать на активные центры белков-мишеней нового коронавируса SARS-CoV-2.

Для этой цели ученые применяют докинг - особый метод молекулярного моделирования, предсказывающий наиболее выгодную ориентацию одной молекулы для образования устойчивого комплекса в центре связывания с другой. Докинг также позволяет оценить энергию связывания этих молекул друг с другом.

"Для многих болезней определены белки, которые отвечают за развитие патологий. Это могут быть вирусные белки, отвечающие за размножение вируса в организме или собственные белки человека, которые работают неправильно. И если мы заблокируем работу такого белка-мишени с помощью молекулы, которая избирательно свяжется с ним в его активном центре, то развитие болезни приостановится", - рассказал заведующий лабораторией вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ Владимир Сулимов.

В настоящее время исследователи проводят на суперкомпьютере МГУ "Ломоносов" масштабные расчеты, которые продлятся несколько дней. Результаты работы проверят экспериментально в лаборатории противовирусных и дезинфекционных средств Института вирусологии им. Д.И.Ивановского.

Однако ученые признают, что это только начало, и настоящего успеха с экспериментальными подтверждениями можно ожидать не ранее чем через несколько месяцев. Проблему создания препаратов против других коронавирусов пытаются решить еще с 2003 года. Проведенные исследования прояснили их функционирование и структуру белков, однако эффективные противовирусные препараты прямого действия для коронавирусов пока не созданы.